抗凝血凝血酶突变W215A / E217A倒塌主要特异性的口袋里。

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皮内AO,陈ZW Caccia年代,坎特维尔,Savvides SN, Waksman G,马修斯FS, Di塞拉E

抗凝血凝血酶突变W215A / E217A倒塌主要特异性的口袋里。

J生物化学杂志。2004年9月17日,279 (38):39824 - 8。Epub 2004年7月13日。

PubMed ID

15252033 (在PubMed

]

文摘

凝血酶突变W215A / E217A特性对显色和自然大大受损的催化活性基质,但有效地激活抗凝蛋白C在thrombomodulin面前。的显著的抗凝性能突变继续瓦解在临床前研究中,我们解决了x射线晶体结构的自由形式和复杂的活性位点抑制剂H-d-Phe-Pro-Arg-CH (2) Cl (PPACK)。W215A PPACK-bound结构/ E217A PPACK-bound缓慢的结构相同形式的凝血酶。另一方面,自由形式的结构揭示了一个崩溃的215 - 217股,把主要的特异性的口袋里。崩溃的结果废除堆积相互作用的板式换热器- 227和trp - 215和极地的相互作用与刺glu - 217 - 172和赖氨酸- 224。其他值得注意的变化是一个旋转的羧基的asp - 189,破损的催化残基之间的H-bond ser - 195和His-57,断裂之间的离子对arg asp - 222和- 187和重大障碍在186 - 220年循环定义Na(+)的网站。这些发现解释W215A的催化活性受损/ E217A和证明的分析由凝血酶底物识别的分子基础和其他蛋白酶需要结晶的自由和约束形式的酶。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Drotrecogin阿尔法	Thrombomodulin	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节