三维定量构效关系分析的基板的人类proton-coupled氨基酸转运蛋白1 (hPAT1)。

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Thondorf我沃伊特V,谢弗,Gebauer年代,Zebisch K, Laug L, Brandsch M

三维定量构效关系分析的基板的人类proton-coupled氨基酸转运蛋白1 (hPAT1)。

Bioorg医疗化学。2011年11月1日,19日(21):6409 - 18。doi: 10.1016 / j.bmc.2011.08.058。Epub 2011 9月5。

PubMed ID

21955456 (在PubMed

]

文摘

proton-coupled氨基酸转运hPAT1最近获得了多少利益由于其运输能力小的药物从而允许其口服。定量构效关系)(3 d三维定量结构活性关系研究一直在执行其自然和合成基板采用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)研究基质的结构要求和得到一个预测模型,可以用于设计新的高活性化合物。的旨在CoMSIA模型来源于一本40训练集化合物和由此产生的模型的预测能力评估与测试组10个化合物。尽管相对狭窄范围的结合亲和力(K值)(我)可靠的统计模型具有良好的预测能力。最好的CoMSIA模型的一个适当的平衡的统计术语和个别属性的总体贡献已经得到考虑立体,疏水性,氢键供体和受体描述符(q (cv)(2) = 0.683,(2) = 0.958和r (PRED) (2) = 0.666)。定量构效关系模型提供3 d insight基质之间的相互作用和hPAT1在分子水平上,并允许亲和常数的预测新化合物。药效团模型训练集的生成通过教育部(分子操作环境)计划。这个模型被用作虚拟筛选查询来检索潜在的新小分子底物,“像”MOE的数据库。预测化合物的亲和力和11个化合物被确定的高亲和性基质。选择两个化合物强烈抑制hPAT介导l - [(3) H]脯氨酸成Caco-2细胞持续表达运输蛋白质的吸收。

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

药物转运蛋白

药物	转运体	类	生物	药理作用	行动
(α)- methylamino异丁酸	Proton-coupled氨基酸转运体1	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
D-Proline	Proton-coupled氨基酸转运体1	Ki (nM)	1600000	N /一个	N /一个	细节
γ-氨基丁酸	Proton-coupled氨基酸转运体1	Ki (nM)	4000000	N /一个	N /一个	细节
羟脯氨酸	Proton-coupled氨基酸转运体1	Ki (nM)	30000000	N /一个	N /一个	细节
氨己烯酸	Proton-coupled氨基酸转运体1	Ki (nM)	4800000	N /一个	N /一个	细节