更新的类固醇基准集及其应用在小说摩尔配体的发现性hormone-binding球蛋白。

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Cherkasov,禁止F, Santos-Filho O, N篇,Fallahi M,哈蒙德GL

更新的类固醇基准集及其应用在小说摩尔配体的发现性hormone-binding球蛋白。

J地中海化学。2008年4月10日,51 (7):2047 - 56。doi: 10.1021 / jm7011485。Epub 2008年3月11日。

PubMed ID

18330978 (在PubMed

]

文摘

基准数据集的类固醇与已知的亲和力为性hormone-binding球蛋白(SHBG)已广泛用于验证流行现场构象分子技术。我们已经扩大了数据集通过添加大量的非甾体类配体识别SHBG从文学和我们先前的实验研究。这个更新的分子组已经使用此开发定量构效关系模型基于4 d“归纳”描述符和洞察protein-ligand相互作用的分子基础。分子结合生成通过对接SHBG活性化合物的活性部位。令人惊讶的是,基准的对齐类固醇与古典ligand-based对齐利用前CoMFA CoMSIA模型还提供模型和更高的统计学意义和预测能力。定量构效关系模型结果结合CoMFA CoMSiA模型以及基于结构的虚拟筛选允许发现几个low-micromolar摩尔SHBG非甾体类抑制剂对人类。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
2-Methoxyestradiol	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.832	N /一个	N /一个	细节
达那唑	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	6.3	N /一个	N /一个	细节
雌二醇	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	1.5	N /一个	N /一个	细节
雌三醇	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	234年	N /一个	N /一个	细节
雌激素酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	6.6	N /一个	N /一个	细节
染料木黄酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	39811年	N /一个	N /一个	细节
氢化可的松	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	631年	N /一个	N /一个	细节
Levonorgestrel	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	1.2	N /一个	N /一个	细节
Methyltestosterone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	3.7	N /一个	N /一个	细节
柚苷配基	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	955年	N /一个	N /一个	细节
柚苷配基	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	28184年	N /一个	N /一个	细节
Norethisterone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	11	N /一个	N /一个	细节
孕酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	115年	N /一个	N /一个	细节
Stanolone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.182	N /一个	N /一个	细节
睾酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.631	N /一个	N /一个	细节