建模的相似性和差异D2-like多巴胺受体和识别中的复合物进行验证。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Boeckler F、H Lanig Gmeiner P
建模的相似性和差异D2-like多巴胺受体和识别中的复合物进行验证。
J医学杂志。2005年2月10;48 (3):694 - 709。
- PubMed ID
-
15689154 (在PubMed]
- 文摘
-
关注的相似性和差异GPCR亚型及其配体的相互作用,我们生成多巴胺D2、D3、D4受体模型的基础上,视紫红质晶体结构和提炼这些广泛的MM / MD协议。经过诊断实验数据,验证subtype-specific TM1的相对位置,2、6、7、弯曲角度TM7被发现。样本的构象空间复杂,我们执行模拟退火的运行与sub-nanomolar拮抗剂spiperone受体蛋白质。对接一组代表性的配体,我们能够识别一个优越的模型为每个亚型当优秀的绑定和实验之间的相关性预测能量亲和力(r2 = 0.72 D2、D3的0.91和0.77 D4)可以观察到。进一步分析发现一般配体相互作用ASP3.32和芳香残留在TM6/7和个人关键交互和TM1 TM2残留D3、D4受体模型,分别。