碳酸酐酶抑制剂:Valdecoxib绑定到一个不同的网站的活跃区域的人类同种型II相比结构相关的环氧酶2抑制剂塞来昔布“选择性”。

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迪菲奥雷,Pedone C, D 'Ambrosio K, Scozzafava,德西蒙G, Supuran CT

碳酸酐酶抑制剂:Valdecoxib绑定到一个不同的网站的活跃区域的人类同种型II相比结构相关的环氧酶2抑制剂塞来昔布“选择性”。

地中海Bioorg化学。2006年1月15日,16 (2):437 - 42。Epub 2005年11月14日。

PubMed ID

16290146 (在PubMed

]

文摘

加合物的高分辨率x射线晶体结构的人类碳酸酐酶(CA, EC 4.2.1.1)同种型II (hCA II)临床使用止痛药valdecoxib,作为一种强有力的CA二世和cyclooxygenase-2 (cox - 2)抑制剂,是报道。的电离磺酰胺基valdecoxib协调到催化锌(II)离子四面体几何。半phenyl-isoxazole抑制剂充满活跃的网站频道和与Gln92的侧链,Val121, Leu198 Thr200, Pro202。3-phenyl集团位于疏水口袋,同时建立范德华相互作用与各种疏水残基的脂肪族侧链(Val135, Ile91, Val121、Leu198 Leu141)和强大的抵消面对面的芳环堆积相互作用Phe131 (chi1旋转约90度角对观察到的原生酶的结构和其他磺酰胺复合物)。beplayapp结构相关的cox - 2抑制剂塞来昔布,早些时候报道了x射线晶体结构,结合以完全不同的方式向valdecoxib hCA II相比。塞来昔布完全填满整个CAⅱ活性部位,其trifluoromethyl组疏水部分的活性部位和p-tolyl一半的亲水性,与Phe131没有建立任何交互。与塞来昔布,valdecoxib旋转约90度的化学键连接benzensulfonamide和取代异beplayapp恶唑环允许这些良好的交互。这些不同的绑定模式允许进一步药物设计各种CA抑制剂属于benzenesulfonamide类。

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多肽

的名字	UniProt ID
碳酸酐酶2	P00918	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
乙酰唑胺	碳酸酐酶1	Ki (nM)	250年	N /一个	N /一个	细节
乙酰唑胺	碳酸酐酶12	Ki (nM)	5.7	N /一个	N /一个	细节
乙酰唑胺	碳酸酐酶2	Ki (nM)	12	N /一个	N /一个	细节
塞来昔布	碳酸酐酶2	Ki (nM)	21	N /一个	N /一个	细节
Diclofenamide	碳酸酐酶1	Ki (nM)	1200年	N /一个	N /一个	细节
Diclofenamide	碳酸酐酶2	Ki (nM)	38	N /一个	N /一个	细节
Dorzolamide	碳酸酐酶1	Ki (nM)	50000年	N /一个	N /一个	细节
Dorzolamide	碳酸酐酶2	Ki (nM)	9	N /一个	N /一个	细节
Valdecoxib	碳酸酐酶2	Ki (nM)	43	N /一个	N /一个	细节