成功的虚拟筛选新的人类碳酸酐酶抑制剂:策略和实验确认。

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Gruneberg年代,斯塔布斯MT, Klebe G

成功的虚拟筛选新的人类碳酸酐酶抑制剂:策略和实验确认。

J地中海化学。2002年8月15日,45 (17):3588 - 602。

PubMed ID
12166932 (在PubMed
]
文摘

虚拟筛选的化合物库是一种替代和补充方法的大规模筛选先导化合物的过程。新战略描述搜索可能导致人类的碳酸酐酶II,连续应用协议的几个层次涉及预选滤波器基于官能团需求和快速药效基因匹配。得到一个合适的药效团的一个复杂的“热点”分析结合位点检测区域有利于protein-ligand交互。在后续步骤中,分子相似性与已知参考配体用于为点击率排名从药效基因匹配。最后最好的得分候选人停靠灵活到蛋白结合的口袋里。考试后的关联预测,13个化合物被选为实验测试。13,三可以证明是subnanomolar,一个是摩尔,另有7个微摩尔的抑制剂。两支安打的绑定模式可以得到晶体结构分析。新奇的发现导致最好支持的事实,在专利文献中搜索显示,新发现subnanomolar化合物组成支架没有被现有的专利。

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多肽
的名字 UniProt ID
碳酸酐酶2 P00918 细节
绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
1-Methyl-3-Oxo-1, 3-Dihydro-Benzo [C] Isothiazole-5-Sulfonic酸酰胺 碳酸酐酶2 集成电路50 (nM) 245.5 7.4 25 细节
(3-Nitro-4) - 2-Oxo-Pyrrolidin-1-Yl -Benzenesulfonamide 碳酸酐酶2 集成电路50 (nM) 0.62 7.4 25 细节
乙酰唑胺 碳酸酐酶2 集成电路50 (nM) 6.7 7.4 25 细节