对接和3 d-qsar(定量结构活性关系)研究黄酮,22针对核苷酸结合域的有效抑制剂。
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崔Kothandan G, Gadhe CG, Madhavan T, CH,秋SJ
对接和3 d-qsar(定量结构活性关系)研究黄酮,22针对核苷酸结合域的有效抑制剂。
欧元J地中海化学。2011年9月,46 (9):4078 - 88。doi: 10.1016 / j.ejmech.2011.06.008。Epub 2011 7月1。
- PubMed ID
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21723648 (在PubMed]
- 文摘
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为了探索黄酮和P-gp之间的交互,在网上进行了对接和3 d-qsar等方法。CoMFA和CoMSIA分析是使用基于配体和受体引导调整方案。验证统计数据包括分析旨在R (2) (q(2)),内部预测参数的渐进地(q(* 2),外部与测试集预测。他们来自本研究表明,模型很健壮。基于配体的CoMFA (q (2) = 0.747, q (* 2) = 0.639, r (pred)(2) = 0.802)和CoMSIA模型(q (2) = 0.810, q (* 2) = 0.676, r (pred)(2) = 0.785)是利用原子的原子匹配。受体引导CoMFA (q (2) = 0.712, q (* 2) = 0.497, r (pred)(2) = 0.841)和CoMSIA (q (2) = 0.805, q (* 2) = 0.589, r (pred)(2) = 0.937)模型是由对接的高活性黄酮提出NBD P-gp(核苷酸结合域)。这里的3 d-qsar模型生成预测,疏水性和空间参数对P-gp活动很重要。我们的研究显示的重要氨基酸NBD绑定按照以前的结果的关键。这个网站形成一个疏水的网站。由于黄酮类化合物有可能没有毒性,我们建议检查一下这疏水网站包括Asn1043和Asp1049应考虑未来的抑制剂的设计。