短杆菌肽D构象,动力学和膜离子运输。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

Burkhart BM, Gassman RM, Langs哒,Pangborn佤邦,Duax西城,纳德普V

短杆菌肽D构象,动力学和膜离子运输。

51生物聚合物。1999;(2):129 - 44。

PubMed ID

10397797 (在PubMed

]

文摘

线性pentadecapeptide抗生素,短杆菌肽D,六个组件的异构混合物,是一种天然产品的短杆菌形成离子通道在合成和天然膜。短杆菌肽构象的固体,在有机溶剂,在平面脂质影响和成分之间的关系,短杆菌肽构象及其选择性离子的跨膜运输一直强烈的主题调查了50多年。x射线晶体结构和解决方案nmr光谱完全同意和显示完全不同构象的短杆菌肽存在于非复杂离子复杂化形式。精确的三维结构的改进天然短杆菌肽D晶体从甲醇,乙醇,正丙醇的意想不到的存在稳定的左撇子反平行的双螺旋形成随结晶溶剂。侧链的残留的三个结构展览sequence-specific构象偏好的模式。酪氨酸的Trp替换位置11似乎忙β带反平行的双螺旋结构的形成和稳定。这为短杆菌肽构象充当模板折叠和晶体成核的不同形式。一个微量组分在异构混合物聚合和影响晶体成核有潜在应用到其他系统中异常行为表现出明显的聚合均匀材料,如朊病毒蛋白质的神秘行为。铯的结晶学确定结构、钾、铷、水合氢离子复合物短杆菌肽是在良好的协议与nmr结构测定甲醇氯仿的铯离子短杆菌肽复杂混合物(50:50)。右手反平行的双链双螺旋结构(DSDHR)也表现出几何特征与固态15 n相一致,2 h nmr数据记录在平面短杆菌肽脂质影响和归因于短杆菌肽a的活性形式DSDHR晶体结构揭示了离子通道与单个部分溶剂化阳离子分布在三个离子结合位点。 The channel lumen is relatively smooth and electrostatically negative as required for cation passage, while the exterior is electrostatically neutral, a requirement for membrane insertion. The "coordination" of the Cs+ ion is achieved by interaction with the pi orbitals of the carbonyls which do not point toward the ions. The K+ binding sites, which are similar in position to Cs+ binding sites, are shifted off center slightly toward the wall of the channel.

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

药物

短杆菌肽D