德国cDNA财团的full-ORF克隆资源。
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贝克特尔年代,罗森菲尔德H,杜达,施密特CP,恩斯特U, Wellenreuther R, Mehrle,舒斯特尔C,巴尔,拦截器H, Heubner D, Hoerlein,米歇尔•G Wedler H, Kohrer K, Ottenwalder B, Poustka, Wiemann年代,思楚普我
德国cDNA财团的full-ORF克隆资源。
BMC基因组学。2007年10月31日,8:399。
- PubMed ID
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17974005 (在PubMed]
- 文摘
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背景:随着人类基因组序列的完成编码蛋白的功能分析和表征已经成为下一个敦促后基因组时代的挑战。缺乏全面ORFeome资源目前阻碍蛋白质功能分析系统的应用程序。基因和ORF覆盖全身的ORF克隆因此需要扩展。结合一个独特的和通用的克隆系统,这些将为全基因组提供的工具系统的功能分析,达到一个更深层次的了解复杂的生物学过程。结果:在这里,我们描述的代full-ORF应用网关克隆技术克隆人类基因资源(表达载体)。管道高效克隆和测序样品开发和跟踪数据库实现简化克隆生产针对超过2200个不同的子过程。此外,建立健壮的克隆策略,允许同时生成两个克隆变异包含一个特定的子以及没有终止密码子的实现只有一个额外的工作进入克隆过程。高达92%的目标并成功放大通过PCR和超过93%的扩增子成功克隆。结论:德国cDNA财团ORFeome资源目前有3800多块骨头组成,sequence-verified条目克隆代表羊痘疮,克隆并没有终止密码子,约1700种不同的基因位点。beplayapp177年拼接代表121个基因变异被克隆。 The entry clones have been used to generate over 5,000 different expression constructs, providing the basis for functional profiling applications. As a member of the recently formed international ORFeome collaboration we substantially contribute to generating and providing a whole genome human ORFeome collection in a unique cloning system that is made freely available in the community.
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的名字 UniProt ID NAD (P) transhydrogenase,线粒体 Q13423 细节 异柠檬酸脱氢酶(NAD)α亚基,线粒体 P50213 细节 3 beta-hydroxysteroid脱氢酶/δ5 - - > 4-isomerase 2型 P26439 细节 铁蛋白轻链 P02792 细节 S-adenosylmethionine脱羧酶酶原 P17707 细节 酮亚胺还原酶mu-crystallin Q14894 细节 腺嘌呤phosphoribosyltransferase P07741 细节 雌激素受体 P03372 细节 溶质载体家庭12成员6 Q9UHW9 细节 双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶 P07814 细节 溶质载体家庭12成员7 Q9Y666 细节 Sodium-coupled中性氨基酸转运体3 Q99624 细节 国民幸福指数/ 6 pgl内质的双功能蛋白 O95479 细节 鸟氨酸转氨酶,线粒体 P04181 细节 Abelson酪氨酸受体激酶2 P42684 细节 白氨酸羧基甲基转移酶1 Q9UIC8 细节 NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形单元5 Q16718 细节 异亮氨酸tRNA连接酶,胞质 P41252 细节 视网膜脱氢酶2 O94788 细节 Branched-chain-amino-acid转氨酶,胞质 P54687 细节 血清白蛋白 P02768 细节 Proton-coupled氨基酸转运体1 Q7Z2H8 细节 异柠檬酸脱氢酶(NAD)β亚基,线粒体 O43837 细节 阳离子氨基酸转运蛋白2 P52569 细节 精胺氧化酶 Q9NWM0 细节 短/支链具体酰coa脱氢酶、线粒体 P45954 细节 角鲨烯单氧酶 Q14534 细节 溶质载体家庭13个成员3 Q8WWT9 细节 Monocarboxylate转运体1 P53985 细节 磷脂酰丝氨酸脱羧酶酶原 Q9UG56 细节 酸感性离子通道2 Q16515 细节 半胱氨酸- tRNA连接酶,胞质 P49589 细节 天冬氨酸——tRNA连接酶,胞质 P14868 细节 N (G)、N (G) -dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 O94760 细节 糖皮质激素受体 P04150 细节 谷胱甘肽S-transferase A4 O15217 细节 谷胱甘肽S-transferaseω₁ P78417 细节 脂肪酸desaturase 1 O60427 细节 Calpastatin P20810 细节 Alpha-2-macroglobulin P01023 细节 胞质10-formyltetrahydrofolate脱氢酶 O75891 细节 血管紧张素转换酶2 Q9BYF1 细节 突触囊泡糖蛋白2 a Q7L0J3 细节 细胞色素c P99999 细节 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2 b1 O94956 细节 弹性蛋白 P15502 细节 Proton-coupled叶酸运输车 Q96NT5 细节 85/88 kDa calcium-independent磷脂酶A2 O60733 细节 鸟嘌呤nucleotide-binding蛋白G (I) / G (S) / G (O)亚基gamma-2 P59768 细节 不活跃的磷脂酶c蛋白1 Q15111 细节 核因子NF-kappa-B施敏原著亚基 P19838 细节 CD44抗原 P16070 细节 膜联蛋白A2 P07355 细节 纤连蛋白 P02751 细节 醌氧化还原酶 Q08257 细节 改变蛋白质RhoA P61586 细节 视紫红质 P08100 细节 异柠檬酸脱氢酶(辅酶ii)胞质 O75874 细节 双重适配器phosphotyrosine和3-phosphotyrosine 3-phosphoinositide Q9UN19 细节 组织蛋白酶F Q9UBX1 细节 白三烯4水解酶 P09960 细节 死亡率蛋白激酶1 P53355 细节 脂肪酸结合蛋白,大脑 O15540 细节 Serpin B5 P36952 细节 Estrogen-related受体γ P62508 细节 补充C1r子组件 P00736 细节 血浆丝氨酸蛋白酶抑制剂 P05154 细节 多种凝血因子缺乏蛋白质2 Q8NI22 细节 Synaptotagmin-like蛋白4 Q96C24 细节 Neuropilin-1 O14786 细节 组织蛋白酶L1 P07711 细节 Vesicle-associated膜蛋白1 P23763 细节 Serpin B6 P35237 细节 SPARC P09486 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sirtuin-5,线粒体 Q9NXA8 细节 高迁移率蛋白B1组 P09429 细节 肿瘤坏死因子受体超家族成员10 b O14763 细节 Ribosome-binding蛋白1 Q9P2E9 细节 Microtubule-associated蛋白4 P27816 细节 大满贯家庭成员7 Q9NQ25 细节 Bcl-2-like蛋白1 Q07817 细节 组蛋白脱乙酰酶7 Q8WUI4 细节 组蛋白脱乙酰酶10 Q969S8 细节 核受体ROR-beta Q92753 细节 视杆rhodopsin-sensitive cGMP 3 ', 5 '环磷酸二酯酶亚基γ P18545 细节 前列腺素还原酶2 Q8N8N7 细节 钙/ calmodulin-dependent 3 ', 5 '环核苷酸磷酸二酯酶1 a P54750 细节 整合素beta 1 P05556 细节 Nischarin Q9Y2I1 细节 γ-氨基丁酸受体亚基gamma 1 Q8N1C3 细节 Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基M2 B Q7LG56 细节 胃三酰甘油脂肪酶 P07098 细节 高亲和力铜吸收蛋白质1 O15431 细节 耐多药resistance-associated蛋白7 Q5T3U5 细节 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1 c1 Q9NYB5 细节 高亲和力cAMP-specific IBMX-insensitive 3 ', 5 '环磷酸二酯酶8 b O95263 细节 Receptor-type酪氨酸受体磷酸酶β P23467 细节 60年代核糖体蛋白由于 P84098 细节 电子转移flavoprotein-ubiquinone氧化还原酶、线粒体 Q16134 细节 Myosin-14 Q7Z406 细节 Glycodelin P09466 细节 二氢叶酸还原酶、线粒体 Q86XF0 细节 保利(ADP-ribose)聚合酶3 Q9Y6F1 细节 延长因子图GTP-binding domain-containing蛋白质1 Q7Z2Z2 细节 Arylacetamide deacetylase-like 2 Q6P093 细节 过氧化物酶病acyl-coenzyme氧化酶1 Q15067 细节 MKL / myocardin-like蛋白1 Q969V6 细节 蛋白质尖顶同族体2 Q8WWL2 细节 丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶催化亚基α2 b同种型 Q08209 细节 Actin-related蛋白2 P61160 细节 酪蛋白激酶gamma 1。我对碘氧基苯甲醚 Q9HCP0 细节 贩卖蛋白质粒子复杂的亚基6 b Q86SZ2 细节 Afadin P55196 细节 II型肌醇1 4 5-trisphosphate 5-phosphatase P32019 细节 tRNA-splicing连接酶RtcB同族体 Q9Y3I0 细节 柠檬酸合成酶,线粒体 O75390 细节 尿苷5 '一磷酸合酶 P11172 细节 cAMP-dependent蛋白激酶催化β亚基 P22694 细节 Ras-related蛋白质Rab-8B Q92930 细节 Inositol-3-phosphate合酶1 Q9NPH2 细节 Fumarylacetoacetase P16930 细节 ADP-ribosylation因子蛋白1 P40616 细节 NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-3,线粒体 Q9NTG7 细节 T-complex蛋白质1亚基γ P49368 细节 N-acylneuraminate cytidylyltransferase Q8NFW8 细节 磷酸丝氨酸磷酸酶 P78330 细节 Pyrroline-5-carboxylate还原酶3 Q53H96 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO2 Q9UL54 细节 Polycomb蛋白质SCMH1 Q96GD3 细节 Carbamoyl-phosphate合成酶(氨),线粒体 P31327 细节 碳酸氢钠转运蛋白3 Q9Y6M7 细节 电中性的碳酸氢钠换热器1 Q2Y0W8 细节 碳酸氢氯化Sodium-driven换热器 Q6U841 细节 古柯碱酯酶 O00748 细节 细胞色素P450 4 f12 Q9HCS2 细节 多种药物和毒素挤压蛋白2 Q86VL8 细节 蛋白质cereblon Q96SW2 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek11 Q8NG66 细节 Ephrin a受体5 P54756 细节 Alpha-enolase P06733 细节 Protocadherin-19 Q8TAB3 细节 Hephaestin-like蛋白1 Q6MZM0 细节 核酸内切酶8-like 2 Q969S2 细节 组蛋白脱乙酰酶11 Q96DB2 细节 Calcium-dependent分泌激活1 Q9ULU8 细节 Calcium-dependent分泌激活2 Q86UW7 细节 二酰基甘油O-acyltransferase 2 Q96PD7 细节 异构核核糖核蛋白H3 P31942 细节 蛋白质RIC-3 Q7Z5B4 细节 微管蛋白monoglycylase TTLL3 Q9Y4R7 细节 剪接因子3 b亚基3 Q15393 细节 原肌球蛋白alpha -链 P09493 细节 Clusterin P10909 细节 异染色质蛋白质1-binding 3 Q5SSJ5 细节 N-acyl-phosphatidylethanolamine-hydrolyzing磷脂酶D Q6IQ20 细节 Myosin-9 P35579 细节 压敏电阻器钙通道亚基α2 / delta 4 Q7Z3S7 细节 非典型激酶COQ8A,线粒体 Q8NI60 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶33 Q9BYT3 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶36 Q9NRP7 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO3 Q9H2K8 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶TNNI3K Q59H18 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK3 Q6PHR2 细节 BMP-2-inducible蛋白激酶 Q9NSY1 细节 钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶激酶2 Q96RR4 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶DCLK2 Q8N568 细节 真核翻译起始因子2α激酶1 Q9BQI3 细节 eIF-2-alpha激酶GCN2 Q9P2K8 细节 Ephrin a受体6 Q9UF33 细节 富亮氨酸重复丝氨酸/ threonine-protein激酶2 Q5S007 细节 增殖蛋白激酶激酶激酶3 Q99759 细节 增殖蛋白激酶激酶激酶激酶4 O95819 细节 地图kinase-activated蛋白激酶5 Q8IW41 细节 CLIP-associating蛋白1 Q7Z460 细节 Megakaryocyte-associated酪氨酸受体激酶 P42679 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek1 Q96PY6 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 4 O96013 细节 膜相关的酪氨酸,threonine-specific cdc2-inhibitory激酶 Q99640 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO1 Q9BRS2 细节 SNF-related丝氨酸/ threonine-protein激酶 Q9NRH2 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶10 O94804 细节 Exportin-1 O14980 细节 增殖蛋白激酶6 Q16659 细节 43溶质载体家庭成员3 Q8NBI5 细节 Lysophosphatidic酸受体6 P43657 细节 溶质载体家庭41成员1 Q8IVJ1 细节 Y + L氨基酸转运蛋白2 Q92536 细节 受体视黄醇STRA6吸收 Q9BX79 细节 锌转运体ZIP10 Q9ULF5 细节 锌转运蛋白7 Q8NEW0 细节 锌转运体8 Q8IWU4 细节 锌转运蛋白5 Q8TAD4 细节 锌转运体10 Q6XR72 细节 锌转运体ZIP13 Q96H72 细节 锌转运蛋白6 Q6NXT4 细节 二酰基甘油激酶埃塔 Q86XP1 细节 v型质子atp酶亚基e 2 Q8NHE4 细节 v型质子atp酶1。116 kDa亚基对碘氧基苯甲醚 Q93050 细节 质膜calcium-transporting atp酶4 P23634 细节 Calcium-transporting atp酶2型c成员2 O75185 细节 PI-PLC X domain-containing蛋白质3 Q63HM9 细节 Lysine-specific组蛋白demethylase 1 O60341 细节 信号传感器和转录激活1α/β P42224 细节 核转录因子2红细胞两个相关因素 Q16236 细节 3-oxoacyl -酰基载体蛋白质还原酶 Q8N4T8 细节 免疫球蛋白受体FcRn大亚基多样 P55899 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