Lys-N和胰蛋白酶覆盖在精制SCX-based法的互补部分组织磷酸化蛋白质组的方法。

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Gauci年代,Helbig AO, Slijper M, Krijgsveld J, AJ,穆罕默德

Lys-N和胰蛋白酶覆盖在精制SCX-based法的互补部分组织磷酸化蛋白质组的方法。

肛门化学2009 81年6月1;(11):4493 - 501。doi: 10.1021 / ac9004309。

PubMed ID

19413330 (在PubMed

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文摘

proteome-wide磷酸化事件的分析仍然是一个主要的分析挑战,因为巨大的蛋白质磷酸化网络的复杂性。在这项工作中,我们评估Lys-N的互补性,Lys-C,胰蛋白酶对他们能力的全球分析磷酸化蛋白质组的贡献。精制的版本低ph值强阳离子交换用于有效地分离氨基乙酰化、磷酸化和nonmodified肽。总共有5036 nonredundant此处则可以识别的错误发现率< 1% 1毫克的蛋白质使用三种酶的结合。我们的数据显示,此处则生成数据集之间的重叠与不同的蛋白酶是边际,而胰蛋白酶的数据集生成的重叠两个同样被发现至少4倍。通过这种方式,并行使用Lys-N和胰蛋白酶启用的数量增加了72%发现此处则比胰蛋白酶,而胰蛋白酶复制实验只增加了25%。因此,当只关注胰蛋白酶和Lys-N数据,我们发现4671 nonredundant此处则。进一步分析发现的网站显示Lys-N和胰蛋白酶的数据集在明显不同磷酸化图案丰富,进一步证明,multiprotease方法分析法非常有价值在组织磷酸化蛋白质组。

beplay体育安全吗DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
糖原磷酸化酶、肝的形式	P06737	细节
乙醇脱氢酶3班	P11766	细节
酪氨酸受体激酶ABL1	P00519	细节
苯丙氨酸——tRNA连接酶α亚基	Q9Y285	细节
丝氨酸- tRNA连接酶,胞质	P49591	细节
丙酮酸激酶11	P14618	细节
腺嘌呤phosphoribosyltransferase	P07741	细节
Alpha-aminoadipic semialdehyde脱氢酶	P49419	细节
DNA连接酶3	P49916	细节
Monocarboxylate运输车8	P36021	细节
谷胱甘肽合成酶	P48637	细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶	P07814	细节
赖氨酸- tRNA连接酶	Q15046	细节
DNA连接酶1	P18858	细节
Pyrroline-5-carboxylate还原酶1,线粒体	P32322	细节
酪氨酸- tRNA连接酶,胞质	P54577	细节
中性氨基酸转运蛋白B (0)	Q15758	细节
嘌呤核苷磷酸化酶	P00491	细节
4-trimethylaminobutyraldehyde脱氢酶	P49189	细节
丙氨酸——tRNA连接酶,胞质	P49588	细节
山梨糖醇脱氢酶	Q00796	细节
亚精胺合成酶	P19623	细节
GMP合成酶(glutamine-hydrolyzing)	P49915	细节
胱硫醚beta-synthase	P35520	细节
Acetyl-coenzyme合成酶,细胞质	Q9NR19	细节
NADH脱氢酶(辅酶q) 1β复形单元6	O95139	细节
维生素K-dependent gamma-carboxylase	P38435	细节
钙调蛋白	P0DP23	细节
L-lactate脱氢酶连锁	P00338	细节
Abelson酪氨酸受体激酶2	P42684	细节
异亮氨酸tRNA连接酶,胞质	P41252	细节
Branched-chain-amino-acid转氨酶,胞质	P54687	细节
Dihydropteridine还原酶	P09417	细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶	P04406	细节
蛋氨酸tRNA连接酶,胞质	P56192	细节
NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形单元2	O43678	细节
丙酮酸脱氢酶α亚基E1组件,躯体形式,线粒体	P08559	细节
血红素加氧酶- 2	P30519	细节
磷酸丝氨酸转氨酶	Q9Y617	细节
NADP-dependent苹果酸脱氢酶	P48163	细节
Choline-phosphate cytidylyltransferase一	P49585	细节
C-1-tetrahydrofolate合酶,胞质	P11586	细节
ADP / ATP移位酶3	P12236	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
干扰素α/β受体1	P17181	细节
Monocarboxylate转运体1	P53985	细节
ADP / ATP移位酶2	P05141	细节
DNA聚合酶α亚基B	Q14181	细节
Inosine-5”一磷酸脱氢酶2	P12268	细节
天冬氨酸——tRNA连接酶,胞质	P14868	细节
Pyrroline-5-carboxylate还原酶2	Q96C36	细节
钠/ potassium-transporting atp酶亚基alpha -	P05023	细节
组氨酸tRNA连接酶,胞质	P12081	细节
胆绿素还原酶一	P53004	细节
DNA拓扑异构酶2α	P11388	细节
醛糖还原酶	P15121	细节
腺苷三磷酸酶ASNA1	O43681	细节
N (G)、N (G) -dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1	O94760	细节
表皮生长因子受体	P00533	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 2	O43741	细节
通过焦磷酸合酶	P14324	细节
耐多药resistance-associated蛋白1	P33527	细节
谷胱甘肽S-transferaseω₁	P78417	细节
Perilipin-3	O60664	细节
CTP合酶1	P17812	细节
adenosine-3三功能性的嘌呤生物合成的蛋白质	P22102	细节
Cyclin-dependent-like激酶5	Q00535	细节
DNA甲基转移酶1 (cytosine-5)	P26358	细节
Calpastatin	P20810	细节
增殖蛋白激酶1	P28482	细节
真核翻译起始因子4 e	P06730	细节
脂肪酸合酶	P49327	细节
Lactoylglutathione裂合酶	Q04760	细节
精胺合成酶	P52788	细节
DNA拓扑异构酶1	P11387	细节
Peptidyl-prolyl顺反异构酶一	P62937	细节
转录因子AP-1	P05412	细节
增殖蛋白激酶3	P27361	细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型11	Q06124	细节
鸟嘌呤nucleotide-binding蛋白G (I) / G (S) / G (O)亚基gamma-2	P59768	细节
Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase	P11413	细节
Hexokinase-1	P19367	细节
热休克蛋白HSP 90 -α	P07900	细节
蛋白激酶Cα型	P17252	细节
核因子抑制剂kappa-B激酶β亚基	O14920	细节
Caspase-3	P42574	细节
Microtubule-associated蛋白1	P78559	细节
14-3-3蛋白ζ/δ	P63104	细节
Glucose-6-phosphate异构酶	P06744	细节
m7GpppX diphosphatase	Q96C86	细节
Thymidylate激酶	P23919	细节
双官能PURH嘌呤生物合成蛋白质	P31939	细节
乙酰辅酶a乙酰转移酶,胞质	Q9BWD1	细节
酪氨酸受体激酶埋头	P41240	细节
微管蛋白alpha-1C链	Q9BQE3	细节
Uridine-cytidine激酶2	Q9BZX2	细节
甲硫氨酸氨肽酶2	P50579	细节
Uroporphyrinogen脱羧酶	P06132	细节
Fructose-bisphosphate醛缩酶一	P04075	细节
烟酰胺/烟碱酸单核苷酸adenylyltransferase 1	Q9HAN9	细节
Caspase-7	P55210	细节
Peroxiredoxin-2	P32119	细节
硫氧还蛋白还原酶1,细胞质	Q16881	细节
脂肪酸结合蛋白,表皮	Q01469	细节
Retinoblastoma-associated蛋白质	P06400	细节
糖原磷酸化酶,大脑的形式	P11216	细节
O-phosphoseryl-tRNA (Sec)硒转移酶	Q9HD40	细节
Methylmalonic酸尿和C型高胱氨酸尿蛋白	Q9Y4U1	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶4	P11802	细节
Egl九同族体1	Q9GZT9	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
CAD蛋白质	P27708	细节
Isoaspartyl肽酶/ L-asparaginase	Q7L266	细节
Phosphoribosylformylglycinamidine合酶	O15067	细节
谷氨酰胺合成酶	P15104	细节
谷氨酰胺,tRNA连接酶	P47897	细节
Glutaredoxin-1	P35754	细节
蛋白酶体亚基β2型	P49721	细节
鸟苷激酶	Q16774	细节
组蛋白脱乙酰酶1	Q13547	细节
组蛋白脱乙酰酶2	Q92769	细节
蛋白质治疗/ geranylgeranyltransferase 1型α亚基	P49354	细节
蛋白激酶C三角洲类型	Q05655	细节
DNA拓扑异构酶2β	Q02880	细节
Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基平方米	P31350	细节
Ephrin b受体4	P54760	细节
E3 ubiquitin-protein连接酶UBR4	Q5T4S7	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-1	Q96EB6	细节
压敏电阻器anion-selective通道蛋白1	P21796	细节
压敏电阻器anion-selective通道蛋白2	P45880	细节
压敏电阻器anion-selective通道蛋白3	Q9Y277	细节
前列腺素E合酶3	Q15185	细节
低氧诱导因子1α抑制剂	Q9NWT6	细节
U1小核核糖核蛋白	P09012	细节
ATP-dependent Clp蛋白酶解蛋白的亚基,线粒体	Q16740	细节
羰基还原酶(NADPH) 1	P16152	细节
粘着斑激酶1	Q05397	细节
核苷二磷酸激酶的	P15531	细节
丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶5	P53041	细节
GDP-mannose 4、6脱水酶	O60547	细节
核苷二磷酸激酶B	P22392	细节
Calpain-1催化亚基	P07384	细节
细胞p53肿瘤抗原	P04637	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1	O14757	细节
Bcl-2-like蛋白2	Q92843	细节
目前上游元件结合蛋白1	Q96AE4	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-alpha调节亚基	P13861	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型一调节亚基	P10644	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶1	Q13233	细节
信号传感器和转录激活3	P40763	细节
Microtubule-associated蛋白4	P27816	细节
酪蛋白激酶我同种型ε	P49674	细节
热休克因子1的蛋白质	Q00613	细节
组蛋白脱乙酰酶7	Q8WUI4	细节
腺苷酸激酶	P55263	细节
Nischarin	Q9Y2I1	细节
DNA聚合酶ε4单元	Q9NR33	细节
DNA聚合酶ε3单元	Q9NRF9	细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体	P11717	细节
核受体共激活剂1	Q15788	细节
核受体共激活剂2	Q15596	细节
丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶2 65 kDa调节亚基α异构体	P30153	细节
Uracil-DNA糖基化酶	P13051	细节
热休克蛋白质同源71 kDa	P11142	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
内心的着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶2 55 kDa调节亚基α异构体	P63151	细节
ADP-ribosylation因子1	P84077	细节
60年代L13a核糖体蛋白质	P40429	细节
NHP2-like蛋白1	P55769	细节
Triosephosphate异构酶	P60174	细节
Myosin-14	Q7Z406	细节
蛋白酶体亚基α2型	P25787	细节
蛋白酶体亚基α3型脊髓灰质炎病毒引起	P25788	细节
蛋白酶体亚基α5型	P28066	细节
蛋白酶体亚基β3型脊髓灰质炎病毒引起	P49720	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶IV型	Q16566	细节
核受体共激活剂5	Q9HCD5	细节
地图kinase-activated蛋白激酶3	Q16644	细节
Hydroxymethylglutaryl-CoA合酶,胞质	Q01581	细节
Geranylgeranyl转移酶2型β亚基	P53611	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶16	Q00536	细节
acetylhydrolase IB单元伽马Platelet-activating因素	Q15102	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型亚基三角洲	Q13557	细节
甲硫氨酸氨肽酶1	P53582	细节
Profilin-1	P07737	细节
Calpain小亚基1	P04632	细节
膜联蛋白A5	P08758	细节
MKL / myocardin-like蛋白1	Q969V6	细节
Destrin	P60981	细节
Cofilin-1	P23528	细节
Actin-related蛋白3	P61158	细节
延长因子2	P13639	细节
SRSF蛋白激酶2	P78362	细节
Afadin	P55196	细节
乙醇脱氢酶(辅酶ii (+))	P14550	细节
CREB-binding蛋白质	Q92793	细节
Acyl-coenzyme thioesterase 13	Q9NPJ3	细节
中介的RNA聚合酶II转录单元1	Q15648	细节
母亲反对decapentaplegic同族体2	Q15796	细节
蛋白质精氨酸N-methyltransferase 3	O60678	细节
波形蛋白	P08670	细节
尿苷5 '一磷酸合酶	P11172	细节
Acyl-CoA-binding蛋白质	P07108	细节
腺苷酸激酶2,线粒体	P54819	细节
Myosin-11	P35749	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-beta调节亚基	P31323	细节
Glycogenin-1	P46976	细节
T-complex蛋白质1亚基γ	P49368	细节
GTP-binding核蛋白质跑	P62826	细节
14-3-3蛋白ε	P62258	细节
过渡内质网腺苷三磷酸酶	P55072	细节
Ubiquitin-like modifier-activating酶1	P22314	细节
排序nexin-3	O60493	细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科5一员	O60264	细节
磷酸丝氨酸磷酸酶	P78330	细节
血影蛋白β链,non-erythrocytic 1	Q01082	细节
剪接体RNA解旋酶DDX39B	Q13838	细节
硒代半胱氨酸裂合酶	Q96I15	细节
瞬时受体电位阳离子通道亚米成员7	Q96QT4	细节
肝细胞生长factor-regulated酪氨酸激酶衬底	O14964	细节
Myc原癌基因蛋白	P01106	细节
Equilibrative核苷转运蛋白2	Q14542	细节
叶酸转运体1	P41440	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶2	P36507	细节
LIM域激酶1	P53667	细节
RalA-binding蛋白1	Q15311	细节
Metallothionein-2	P02795	细节
膜相关组件1孕激素受体	O00264	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基gamma-2	Q9UGJ0	细节
循环AMP-dependent ATF-2转录因子	P15336	细节
肌动蛋白、胞质1	P60709	细节
肌动蛋白、胞质2	P63261	细节
Sodium-dependent磷酸盐转运蛋白1	Q8WUM9	细节
组蛋白H1.4	P10412	细节
氯细胞内蛋白质1频道	O00299	细节
CCAAT / enhancer-binding蛋白β	P17676	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶MLT	Q9NYL2	细节
Dihydropyrimidinase-related蛋白2	Q16555	细节
核仁的和coiled-body磷蛋白质1	Q14978	细节
蛋白质O-GlcNAcase	O60502	细节
Sodium-dependent磷酸盐转运蛋白2	Q08357	细节
Metallothionein-1X	P80297	细节
Calmodulin-2	P0DP24	细节
Calmodulin-3	P0DP25	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白H	P31943	细节
剪接因子,脯氨酸和多	P23246	细节
受体的激活蛋白激酶C 1	P63244	细节
Stress-induced-phosphoprotein 1	P31948	细节
Hepatoma-derived生长因子	P51858	细节
Ran-specific GTPase-activating蛋白质	P43487	细节
Cystatin-B	P04080	细节
杭丁顿蛋白	P42858	细节
Cap-specific mRNA (nucleoside-2 ' - o -甲基转移酶1	Q8N1G2	细节
RuvB-like 2	Q9Y230	细节
线粒体ATP合酶亚基g	O75964	细节
异构核核糖核蛋白F	P52597	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
热休克蛋白105 kDa	Q92598	细节
核迁移蛋白质nudC	Q9Y266	细节
26 s蛋白酶调节亚基6	P17980	细节
剪接因子3单元3	Q12874	细节
肿瘤蛋白质D54	O43399	细节
原肌球蛋白alpha 4链	P67936	细节
Desmoplakin	P15924	细节
KAT8监管NSL复杂的亚基3	Q9P2N6	细节
目前上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
Filamin-A	P21333	细节
异构核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60年代核糖体蛋白L4	P36578	细节
40年代S18核糖体蛋白美国	P62269	细节
40年代核糖体蛋白S5	P46782	细节
40年代S8核糖体蛋白质	P62241	细节
剪接因子1	Q15637	细节
Transgelin-2	P37802	细节
Zyxin	Q15942	细节
生存运动神经元蛋白质	B4DP61	细节
Myosin-9	P35579	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶3	Q13188	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶33	Q9BYT3	细节
STE20 / SPS1-related proline-alanine-rich蛋白激酶	Q9UEW8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO1	Q7L7X3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 2	Q86UE8	细节
TRAF2 NCK-interacting蛋白激酶	Q9UKE5	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK1	O75385	细节
AP2-associated蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
BMP-2-inducible蛋白激酶	Q9NSY1	细节
Citron Rho-interacting激酶	O14578	细节
酪蛋白激酶我同种型α	P48729	细节
Cyclin-G-associated激酶	O14976	细节
糖原合成酶激酶3α	P49840	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶LATS1	O95835	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶3	P46734	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶4	Q9Y6R4	细节
地图kinase-activated蛋白激酶5	Q8IW41	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK2	Q7KZI7	细节
地图/微管affinity-regulating激酶3	P27448	细节
CLIP-associating蛋白1	Q7Z460	细节
Megakaryocyte-associated酪氨酸受体激酶	P42679	细节
Misshapen-like激酶1	Q8N4C8	细节
平滑肌肌球蛋白轻链激酶	Q15746	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶OSR1	O95747	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 1	Q13153	细节
磷脂酰肌醇5-phosphate 4-kinase 2型γ	Q8TBX8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶D1	Q15139	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PRP4同族体	Q13523	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO1	Q9BRS2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO2	Q9BVS4	细节
SNF-related丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9NRH2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶10	O94804	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2	Q15910	细节
经营领域,二班,转录因子1	P14859	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-2	Q8IXJ6	细节
肌营养不良蛋白	P11532	细节
锌转运体ZIP6	Q13433	细节
v型质子atp酶亚基1 E	P36543	细节
受体酪氨酸蛋白激酶	Q504U8	细节
UbiA prenyltransferase domain-containing蛋白质1	Q9Y5Z9	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ATR	Q13535	细节
真核翻译起始因子4 e结合蛋白1	Q13541	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
组蛋白乙酰转移酶p300	Q09472	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶4	P45985	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶7	O14733	细节
细胞凋亡调节伯灵顿	Q07812	细节