大规模的人类激酶组的蛋白质组学分析。

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Oppermann FS, Gnad F,奥尔森的合资企业,公司R·Greff Z,克里G,曼M,涂抹H

大规模的人类激酶组的蛋白质组学分析。

摩尔细胞蛋白质组学。2009年7月,8 (7):1751 - 64。doi: 10.1074 / mcp.M800588-MCP200。Epub 2009年4月15日。

PubMed ID

19369195 (在PubMed

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文摘

人类蛋白激酶家族成员的主要调控酶参与活动控制真核生物信号转导通路。作为蛋白激酶驻留phosphorylation-based节点的信号传输,综合分析细胞的表达和特定站点磷酸化可以提供重要的见解信号网络的体系结构和功能。然而,在全球蛋白质组研究,蛋白激酶往往导致细胞丰度低,而闭塞的小肽物种大量过剩的从其他细胞蛋白肽。这些分析的局限性创建一个理由kinome-wide浓缩蛋白激酶在质谱分析之前。在这里,我们采用稳定同位素标记的氨基酸在细胞培养(SILAC)比较的绑定特性三个kinase-selective亲和树脂通过定量质谱。评估pre-fractionation工具拥有pyrido [2, 3 - d] pyrimidine-based激酶抑制剂作为固定化捕获配体和保留了相当大的人类激酶组的子集。基于这些结果,一个亲和树脂显示广泛的选择性激酶配体VI16832采用量化的相对表达超过170在三个不同的蛋白激酶,SILAC-encoded癌症细胞系。这些实验证明了可行性比较激酶组分析实验紧凑格式。有趣的是,我们发现高水平的胞质和低水平的受体酪氨酸激酶MV4-11白血病细胞与附着癌症HCT116谱线和mda - mb - 435 s。VI16832树脂进一步利用为目标phosphoproteomics pre-fractionate激酶分析,显示大约1200不同的网站超过200蛋白激酶磷酸化。beplayapp This hitherto largest survey of site-specific phosphorylation across the kinome significantly expands the basis for functional follow-up studies on protein kinase regulation. In conclusion, the straightforward experimental procedures described here enable different implementations of kinase-selective proteomics with considerable potential for future signal transduction and kinase drug target analysis.

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多肽

的名字	UniProt ID
酪氨酸受体激酶ABL1	P00519	细节
胱氨酸/谷氨酸转运体	Q9UPY5	细节
7-dehydrocholesterol还原酶	Q9UBM7	细节
胰岛素受体	P06213	细节
吡哆醛激酶	O00764	细节
腺嘌呤phosphoribosyltransferase	P07741	细节
FLT3 Receptor-type酪氨酸受体激酶	P36888	细节
Ribosyldihydronicotinamide脱氢酶(醌)	P16083	细节
中性氨基酸转运体大小亚基1	Q01650	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 1	Q9Y478	细节
激活素受体1型	Q04771	细节
过氧化物酶病多功能酶2型	P51659	细节
Abelson酪氨酸受体激酶2	P42684	细节
桅杆/干细胞生长因子受体工具包	P10721	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
营和cAMP-inhibited cGMP 3 ', 5 '环磷酸二酯酶10	Q9Y233	细节
Monocarboxylate转运体1	P53985	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶催化亚基alpha -	Q13131	细节
纤维母细胞生长因子受体2	P21802	细节
表皮生长因子受体	P00533	细节
激活CDC42激酶1	Q07912	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 2	O43741	细节
原癌基因酪氨酸受体激酶Src	P12931	细节
酪氨酸受体激酶菲英岛	P06241	细节
酪氨酸受体激酶是的	P07947	细节
Ephrin a受体2	P29317	细节
酪氨酸受体激酶Lck	P06239	细节
巨噬细胞集落刺激因子1受体	P07333	细节
胰岛素样生长因子1受体	P08069	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶1	Q02750	细节
酪氨酸蛋白激酶2β	Q14289	细节
蛋白激酶C测试类型	P05771	细节
Cyclin-dependent-like激酶5	Q00535	细节
肝细胞生长因子受体	P08581	细节
增殖蛋白激酶1	P28482	细节
磷脂酰肌醇3-kinase调节亚基α	P27986	细节
脂肪酸合酶	P49327	细节
胰岛素受体底物1	P35568	细节
Calnexin	P27824	细节
增殖蛋白激酶14	Q16539	细节
增殖蛋白激酶3	P27361	细节
糖原合成酶激酶3β	P49841	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶2	P24941	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
磷脂酰丝氨酸合酶1	P48651	细节
上皮discoidin domain-containing受体1	Q08345	细节
核因子抑制剂kappa-B激酶β亚基	O14920	细节
胸苷激酶,胞质	P04183	细节
酪氨酸受体激酶BTK	Q06187	细节
酪氨酸受体激酶麦克米兰	P43405	细节
蛋白激酶Cθ类型	Q04759	细节
酪氨酸受体激酶HCK	P08631	细节
双特异性蛋白激酶CLK1	P49759	细节
鉴定及受体2型	P37173	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
cGMP-dependent 3 ', 5 '环磷酸二酯酶	O00408	细节
角蛋白,II型细胞骨架8	P05787	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶9	P50750	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶6	Q00534	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶4	P11802	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶8	P49336	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
磷脂酰丝氨酸合酶2	Q9BVG9	细节
磷脂酰肌醇3-kinase调节亚基β	O00459	细节
依赖dna的蛋白激酶催化亚基	P78527	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶mTOR	P42345	细节
磷脂酰肌醇4,5-bisphosphate 3-kinase催化亚基δ同种型	O00329	细节
原癌基因Ret酪氨酸受体激酶受体	P07949	细节
蛋白激酶C三角洲类型	Q05655	细节
Ephrin b受体4	P54760	细节
前列腺素E合酶3	Q15185	细节
脱氧胞苷激酶	P27707	细节
粘着斑激酶1	Q05397	细节
整合素β4	P16144	细节
酪蛋白激酶gamma-2。我对碘氧基苯甲醚	P78368	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1	O14757	细节
增殖蛋白激酶11	Q15759	细节
增殖蛋白激酶13	O15264	细节
极光激酶B	Q96GD4	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-alpha调节亚基	P13861	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型一调节亚基	P10644	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶1	Q13233	细节
热休克蛋白beta 1	P04792	细节
Microtubule-associated蛋白4	P27816	细节
酪氨酸受体激酶JAK3	P52333	细节
酪蛋白激酶我同种型ε	P49674	细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体	P11717	细节
磷脂酰肌醇3 3-kinase催化亚基类型	Q8NEB9	细节
Cyclin-A2	P20248	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PLK1	P53350	细节
cAMP-dependent蛋白激酶催化亚基α	P17612	细节
增殖蛋白激酶9	P45984	细节
鉴定及受体1型	P36897	细节
增殖蛋白激酶8	P45983	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型β亚基	Q13554	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek2	P51955	细节
内心的着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
60年代核糖体蛋白课时	P61313	细节
60年代L3核糖体蛋白质	P39023	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶/内切核糖核酸酶IRE1	O75460	细节
酪蛋白激酶gamma-3。我对碘氧基苯甲醚	Q9Y6M4	细节
酪蛋白激酶ⅱα亚基的	P19784	细节
STE20-like丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9H2G2	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶16	Q00536	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Sgk1	O00141	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型亚基三角洲	Q13557	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶26	Q9P289	细节
酪氨酸受体激酶JAK1	P23458	细节
Non-receptor酪氨酸受体激酶TYK2	P29597	细节
Destrin	P60981	细节
Cofilin-1	P23528	细节
酪氨酸受体激酶Mer	Q12866	细节
核糖体蛋白S6激酶alpha -	Q15418	细节
酪氨酸受体激酶林恩	P07948	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶17 b	O94768	细节
中介的RNA聚合酶II转录单元1	Q15648	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型亚基γ	Q13555	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶9	P80192	细节
Ephrin b受体2	P29323	细节
过渡内质网腺苷三磷酸酶	P55072	细节
血影蛋白β链,non-erythrocytic 1	Q01082	细节
核糖体蛋白S6激酶alpha 4	O75676	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO2	Q9UL54	细节
Discoidin domain-containing受体2	Q16832	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶2	P36507	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶2	Q9Y2U5	细节
LIM域激酶1	P53667	细节
RalA-binding蛋白1	Q15311	细节
丝氨酸即激酶ATM	Q13315	细节
核糖体蛋白S6激酶alpha 3	P51812	细节
膜相关组件1孕激素受体	O00264	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶催化亚基α2	P54646	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基gamma-2	Q9UGJ0	细节
钙/ calmodulin-dependent 3 ', 5 '环核苷酸磷酸二酯酶1 c	Q14123	细节
酪蛋白激酶ⅱβ亚基	P67870	细节
酪氨酸受体激酶Fgr	P09769	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶MLT	Q9NYL2	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白H3	P31942	细节
Hepatoma-derived生长因子	P51858	细节
磷脂酰肌醇4-kinase类型2β	Q8TCG2	细节
Beclin-1	Q14457	细节
异构核核糖核蛋白F	P52597	细节
热休克蛋白105 kDa	Q92598	细节
Desmoplakin	P15924	细节
Hornerin	Q86YZ3	细节
目前上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
异构核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60年代L14核糖体蛋白质	P50914	细节
40年代核糖体蛋白肌力	P08708	细节
生存运动神经元蛋白质	B4DP61	细节
Myosin-9	P35579	细节
骨形态形成蛋白受体2型	Q13873	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶24	Q9Y6E0	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶3	Q13188	细节
酪氨酸受体激酶Tec	P42680	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO1	Q7L7X3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO3	Q9H2K8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TBK1	Q9UHD2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 1	Q9UKI8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 2	Q86UE8	细节
TRAF2 NCK-interacting蛋白激酶	Q9UKE5	细节
Non-receptor酪氨酸受体激酶TNK1	Q13470	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK1	O75385	细节
AP2-associated蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
BMP-2-inducible蛋白激酶	Q9NSY1	细节
双特异性蛋白激酶CLK2	P49760	细节
双特异性蛋白激酶CLK4	Q9HAZ1	细节
酪蛋白激酶我同种型α	P48729	细节
eIF-2-alpha激酶GCN2	Q9P2K8	细节
Ephrin a受体1	P21709	细节
Ephrin a受体4	P54764	细节
酪氨酸受体激酶拿来	P16591	细节
酪氨酸受体激酶菲斯/ Fps	P07332	细节
Cyclin-G-associated激酶	O14976	细节
糖原合成酶激酶3α	P49840	细节
Homeodomain-interacting蛋白激酶2	Q9H2X6	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶难闻	Q9UPZ9	细节
核因子抑制剂kappa-B激酶亚基ε	Q14164	细节
Interleukin-1 receptor-associated激酶3	Q9Y616	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶SIK3	Q9Y2K2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶LATS1	O95835	细节
LIM域激酶2	P53671	细节
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增殖蛋白激酶激酶激酶10	Q02779	细节
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增殖蛋白激酶激酶激酶12	Q12852	细节
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NUAK家庭SNF1-like激酶1	O60285	细节
NUAK家庭SNF1-like激酶2	Q9H093	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 4	O96013	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶17	Q00537	细节
磷脂酰肌醇5-phosphate 4-kinaseβ2型	P78356	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PLK4	O00444	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶D1	Q15139	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO2	Q9BVS4	细节
Receptor-interacting丝氨酸/ threonine-protein激酶2	O43353	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶SIK2	Q9H0K1	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶10	O94804	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶17	Q9UEE5	细节
增殖蛋白激酶6	Q16659	细节
细胞色素b还原酶1	Q53TN4	细节
atp柠檬酸合酶	P53396	细节
受体酪氨酸受体激酶erbB-3	P21860	细节
受体酪氨酸蛋白激酶	Q504U8	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶4	P45985	细节