通过质谱鉴定n端肽，探索蛋白质组，分析蛋白质加工。

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吉瓦尔特K，戈塔尔M，马丁斯L，云顿J，斯塔斯A，托马斯GR，范德克霍夫J

通过质谱鉴定n端肽，探索蛋白质组，分析蛋白质加工。

生物技术。2003年5月;21(5):566-9。Epub 2003 3月31日。

PubMed ID

12665801 (PubMed视图

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摘要

目前用于分析蛋白质组的非凝胶技术严重依赖于酶消化蛋白质混合物的质谱分析。在分析之前，高度复杂的肽混合物要么在多维色谱系统上分离，要么首先通过分离具有代表性的肽集来降低复杂性。最近，我们开发了一种基于对角线电泳和对角线层析的肽分离方法。我们称之为联合分数对角线色谱法(COFRADIC)。在之前的实验中，我们使用cofrdic对分离的含蛋氨酸多肽进行串联质谱(MS/MS)分析，鉴定了800多种大肠杆菌蛋白。在这里，我们描述了一种分离n端肽的对角线方法。这降低了肽样本的复杂性，因为每个蛋白质有一个N端，因此只由一个肽表示。在这个新过程中，蛋白质中的游离氨基首先被乙酰化阻塞，然后用胰蛋白酶消化。在反相(RP)色谱分离生成的肽混合物后，使用2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)阻断内部肽;它们表现出强烈的疏水位移，因此在第二个相同的分离步骤中从未改变的n端肽中分离出来。 N-terminal peptides can thereby be specifically collected for further liquid chromatography (LC)-MS/MS analysis. Omitting the acetylation step results in the isolation of non-lysine-containing N-terminal peptides from in vivo blocked proteins.

beplay体育安全吗引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
微管蛋白β -1链	Q9H4B7	细节
苯丙氨酸-tRNA连接酶α亚基	Q9Y285	细节
转酮醇酶	P29401	细节
氨乙酰丙酸脱水酶	P13716	细节
丙酮酸激酶PKM	P14618	细节
腺嘌呤phosphoribosyltransferase	P07741	细节
血红蛋白亚单位	P69905	细节
依赖nadd的苹果酶，线粒体	P23368	细节
酪氨酸-tRNA连接酶，细胞质	P54577	细节
山梨糖醇脱氢酶	Q00796	细节
转体基因	P02766	细节
异戊二醛辅酶a脱氢酶，线粒体	P26440	细节
血清白蛋白	P02768	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 α亚复合体亚基11	Q86Y39	细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶	P04406	细节
c -1-四氢叶酸合酶，细胞质	P11586	细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶FKBP1A	P62942	细节
谷胱甘肽s转移酶P	P09211	细节
血小板糖蛋白IX	P14770	细节
L-xylulose还原酶	Q7Z4W1	细节
蛋白激酶C型	P05771	细节
丝裂原活化蛋白激酶1	P28482	细节
血小板碱性蛋白	P02775	细节
精胺合成酶	P52788	细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶A	P62937	细节
丝裂原活化蛋白激酶14	Q16539	细节
血小板糖蛋白Ib α链	P07359	细节
冯·维勒布兰德因子	P04275	细节
Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase	P11413	细节
蛋白激酶C α型	P17252	细节
整合素β3	P05106	细节
Endoplasmin	P14625	细节
14-3-3蛋白质zeta/delta	P63104	细节
过氧化氢酶	P04040	细节
组氨酸三核苷酸结合蛋白1	P49773	细节
二磷酸果糖醛缩酶A	P04075	细节
巨噬细胞迁移抑制因子	P14174	细节
脂肪酸结合蛋白，表皮	Q01469	细节
纤维蛋白原链	P02675	细节
蛋白质ERGIC-53	P49257	细节
糖原磷酸化酶，大脑形成	P11216	细节
脂肪酸酰胺水解酶1	O00519	细节
谷氨酰胺- trna (Gln)酰胺转移酶亚基B，线粒体	O75879	细节
N-acetyl-D-glucosamine激酶	Q9UJ70	细节
蛋白质disulfide-isomerase	P07237	细节
Wiskott-Aldrich综合征蛋白	P42768	细节
膜联蛋白A3	P12429	细节
淀粉样蛋白A4蛋白	P05067	细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基	P10644	细节
载脂蛋白-ⅰ	P02647	细节
Gelsolin	P06396	细节
Destrin	P60981	细节
Cofilin-1	P23528	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基1B	O15143	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基2	O15144	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基3	O15145	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基4	P59998	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基5	O15511	细节
硫代硫酸盐sulfurtransferase	Q16762	细节
Acyl-CoA-binding蛋白质	P07108	细节
Galectin-1	P09382	细节
延伸因子Tu，线粒体	P49411	细节
14-3-3蛋白质	P62258	细节
过渡内质网atp酶	P55072	细节
排序nexin-3	O60493	细节
真核翻译起始因子2亚基3	P41091	细节
Peroxiredoxin-6	P30041	细节
角蛋白，I型细胞骨架12	Q99456	细节
肌动蛋白，细胞质1	P60709	细节
肌动蛋白，细胞质2	P63261	细节
溶酶体保护蛋白	P10619	细节
60kda热休克蛋白，线粒体	P10809	细节
Alpha-actinin-1	P12814	细节
14-3-3蛋白β / α	P31946	细节
蛋白质二硫异构酶A3	P30101	细节
RuvB-like 2	Q9Y230	细节
原肌凝蛋白-4链	P67936	细节
14-3-3蛋白eta	Q04917	细节
14-3-3蛋白质θ	P27348	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
角蛋白，II型细胞骨架	P04264	细节
ATP合酶亚基O，线粒体	P48047	细节
Transgelin-2	P37802	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶1型	Q14012	细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体12型	Q05209	细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1	Q13541	细节