人类10号染色体的DNA序列及比较分析。
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人类10号染色体的DNA序列及比较分析。
自然科学。2004年5月27日;429(6990):375-81。
- PubMed ID
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15164054 (PubMed视图]
- 摘要
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人类10号染色体的完整序列共有131,666,441个碱基对。它代表99.4%的纯色DNA,在染色体的短臂和长臂的近熵区包括1兆的异色序列。序列注释共发现1357个基因,其中蛋白编码基因816个,伪基因430个。我们观察到广泛存在的重叠编码基因(任一链),并鉴定出67个反义转录本。我们的分析表明,染色体间和染色体内的片段重复都影响了10号染色体上的基因计数。多物种比较分析表明,利用现有资源可以很容易地对蛋白质编码基因进行注释。我们估计95%以上的编码外显子在这项研究中被识别出来。对人类10号染色体和黑猩猩序列之间单碱基变化的评估显示,相对于人类序列,只有21个编码基因发生无义突变。
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- 多肽
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的名字 UniProt ID 固醇-4-羧酸3-脱氢酶,脱羧 Q15738 细节 脯氨酸4-羟化酶亚基α -1 P13674 细节 突触泡胺转运体 Q05940 细节 醛酮还原酶家族1成员C1 Q04828 细节 β -1肾上腺素能受体 P08588 细节 谷氨酸脱氢酶1,线粒体 P00367 细节 花生四烯酸5-lipoxygenase P09917 细节 视黄醇结合蛋白3 P10745 细节 细胞质嘌呤5'-核苷酸酶 P49902 细节 α - 2a肾上腺素能受体 P08913 细节 视黄醇结合蛋白4 P02753 细节 类固醇17-羟化酶/17,20裂解酶 P05093 细节 s -腺苷蛋氨酸合成酶亚型1型 Q00266 细节 鸟氨酸转氨酶,线粒体 P04181 细节 蛋氨酸- r -亚砜还原酶B2,线粒体 Q9Y3D2 细节 醛酮还原酶家族1成员C4 P17516 细节 苏氨酸合成酶样1 Q8IYQ7 细节 胆碱O-acetyltransferase P28329 细节 天门冬氨酸转氨酶,细胞质 P17174 细节 钙活化钾通道亚单位α -1 Q12791 细节 短链/支链特异性酰基辅酶a脱氢酶,线粒体 P45954 细节 醛酮还原酶家族1成员C3 P42330 细节 醛酮还原酶家族1成员C2 P52895 细节 5-羟色胺受体7 P34969 细节 白细胞介素2受体亚单位 P01589 细节 神经元特异性囊泡蛋白钙质 Q9NYX4 细节 NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合体亚基8,线粒体 O95169 细节 胰三酰甘油脂肪酶 P16233 细节 成纤维细胞生长因子受体2 P21802 细节 谷胱甘肽s -转移酶-1 P78417 细节 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate合酶 P54886 细节 尿激酶型纤溶酶原激活剂 P00749 细节 Cubilin O60494 细节 管状多特异性有机阴离子转运体 Q92887 细节 周期蛋白依赖性激酶1 P06493 细节 肺表面活性剂相关蛋白D P35247 细节 Hexokinase-1 P19367 细节 Methylated-DNA——protein-cysteine甲基转移酶 P16455 细节 基质细胞衍生因子1 P48061 细节 Prosaposin P07602 细节 降解酶 P14735 细节 蛋白激酶C型 Q04759 细节 肽酰脯氨酸顺反异构酶F,线粒体 P30405 细节 Caspase-7 P55210 细节 激酶样蛋白KIF11 P52732 细节 植物酰辅酶a双加氧酶 O14832 细节 Neuropilin-1 O14786 细节 谷氨酸受体向离子型,-1 Q9ULK0 细节 谷胱甘肽s -转移酶-2 Q9H4Y5 细节 电压依赖性l型钙通道亚基β -2 Q08289 细节 核因子nf -kappa- bp100亚基 Q00653 细节 原癌基因酪氨酸蛋白激酶受体Ret P07949 细节 神经肽Y受体4型 P50391 细节 nadd依赖蛋白去乙酰化酶sirtuin-1 Q96EB6 细节 电压依赖性阴离子选择通道蛋白2 P45880 细节 缺氧诱导因子1- α抑制剂 Q9NWT6 细节 tRNA(胞嘧啶(38)- c(5))甲基转移酶 O14717 细节 细胞色素P450 2C9 P11712 细节 细胞色素P450 2C8 P10632 细节 Pleckstrin同源结构域含家族A成员 Q9HB21 细节 游离脂肪酸受体4 Q5NUL3 细节 DNA损伤诱导转录4蛋白 Q9NX09 细节 细胞色素P450 26A1 O43174 细节 细胞色素P450 2E1 P05181 细节 细胞色素P450 2C19 P33261 细节 腺苷酸激酶 P55263 细节 受体型酪氨酸蛋白磷酸酶 P23469 细节 整合素beta 1 P05556 细节 细胞色素P450 2C18 P33260 细节 胃三酰甘油脂肪酶 P07098 细节 矩阵metalloproteinase-21 Q8N119 细节 甘氨酸n -十四羧基转移酶2 O60551 细节 丝裂原活化蛋白激酶8 P45983 细节 ATP合酶亚单位γ,线粒体 P36542 细节 ste20样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 Q9H2G2 细节 异戊基二磷酸δ异构酶1 Q13907 细节 钙/钙调素依赖性蛋白激酶1D型 Q8IU85 细节 钙/钙调素依赖性蛋白激酶II型亚单位 Q13555 细节 波形蛋白 P08670 细节 类tolloid蛋白2 Q9Y6L7 细节 肺表面活性剂相关蛋白A1 Q8IWL2 细节 DNA nucleotidylexotransferase P04053 细节 烯酰辅酶a水合酶,线粒体 P30084 细节 邻苯二酚o -甲基转移酶结构域蛋白1 Q86VU5 细节 adp核糖化因子样蛋白3 P36405 细节 核因子κ b激酶亚单位α的抑制剂 O15111 细节 锥体cgmp特异性3',5'-环磷酸二酯酶亚基α ' P51160 细节 透明质酸结合蛋白2 Q14520 细节 亚砷酸甲基转移酶 Q9HBK9 细节 肌动蛋白,主动脉平滑肌 P62736 细节 核仁和盘状体磷蛋白1 Q14978 细节 蛋白质O-GlcNAcase O60502 细节 金属转运体CNNM2 Q9H8M5 细节 多囊肾2-样1蛋白 Q9P0L9 细节 异质核核糖核蛋白F P52597 细节 细胞色素P450 26C1 Q6V0L0 细节 胰蛋白酶间抑制剂重链H2 P19823 细节 巨噬细胞甘露糖受体1 P22897 细节 Myosin-IIIa Q8NEV4 细节 1, 5-anhydro-D-fructose还原酶 Q96JD6 细节 锌转运剂ZIP12 Q504Y0 细节 平衡核苷转运体3 Q9BZD2 细节 增殖标志蛋白Ki-67 P46013 细节