催化机理,解释了丝氨酸脱水酶催化活性低1从人类癌细胞:晶体结构和定点诱变研究。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
山田T, Komoto J, Kasuya T,中国人Y,小川H, Mori H, Takusagawa F
催化机理,解释了丝氨酸脱水酶催化活性低1从人类癌细胞:晶体结构和定点诱变研究。
Biochim Biophys学报。2008年5月,1780 (5):809 - 18。doi: 10.1016 / j.bbagen.2008.01.020。Epub 2008年2月19日。
- PubMed ID
-
18342636 (在PubMed]
- 文摘
-
SDH (l-serine脱水酶,EC 4.3.1.17)是一个pyridoxal-5的磷酸盐(PLP)端依赖酶的催化脱水条件下/刺产生丙酮酸/ ketobutyrate和氨。SDH同种型(问题)发现在人类癌症细胞系相比相对较低的催化活性与肝酶(hSDH)。委员会已经确定的晶体结构为2.8埃分辨率。一个由席夫碱共价连接到K48链接中活跃的站点。环氮的过程中与C309 H-bonding,但显然不是质子化了的。23个氨基酸残基组成的活性部位表面被确定。人类和鼠肝酶(hSDH和rSDH)有相同的残留物,而残留G72 A172,委员会部分A66公路关闭所取代,和S228 S166, hSDH A222,分别。这些残留物hSDH和问题突变使互补双突变酶及其动力学参数测定。C303 hSDH和C309 H-bonding伙伴的问题PLP被突变的环氮丙氨酸及其动力学参数也被确定。晶体结构和突变数据表明,甘氨酸72残留的问题的主要原因是降低催化活性的问题。 Changing alanine to glycine at residue 72 increases the flexibility of the substrate binding-loop (71S(G/A)GN74), so that the bound substrate and PLP are not pushed deep into the active cleft. Consequently, the proton transfer rate from S(G) of C309 to N1 of the bound PLP is decreased, which determines the rate of catalytic reaction.