鸟氨酸脱羧酶促进催化通过绑定在397年埋袋含有苯丙氨酸羧酸盐。
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杰克逊路,布鲁克斯HB,迈尔斯DP,菲利普斯马
鸟氨酸脱羧酶促进催化通过绑定在397年埋袋含有苯丙氨酸羧酸盐。
生物化学,2003年3月18日,42 (10):2933 - 40。
- PubMed ID
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12627959 (在PubMed]
- 文摘
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鸟氨酸脱羧酶(ODC)是一种吡哆醛5 '磷酸(PLP)相关的酶,这种酶能够催化l-Orn进行脱羧反应的酶腐胺,病原反应一步多胺的形成。ODC的x射线晶体结构,一些配体混合时,支持面向模型底物在哪里carboxyl-leaving组埋在面对领导,代数余子式的。这个绑定网站由疏水性和负电子的残留物,在板式换热器- 397预计形成密切联系。突变的板式换热器- 397 Ala减少稳态产物的生成速率的150倍。此外,单一的营业额分析表明羧步骤的速率下降了2100倍,导致这个步骤替换产品发布的病原反应一步突变酶。这些数据支持的结构预测carboxyl-leaving组定位与板式换热器- 397。多波长stopped-flow反应中间体的分析表明,突变体酶反应的主要产品是pyridoximine 5 '磷酸(PMP),造成错误的质子化作用的脱羧中间C4的位置。这一发现被反应产物的高效液相色谱分析证实,证明板式换热器- 397中也扮演了重要的角色在维持化学反应的完整性。发现carboxylate-leaving集团是面向埋一边,代数余子式表明ODC促进脱羧的不稳定带电衬底羧基赞成一个静电更中立的过渡态。