氨基酸脱羧酶的功能分类丙氨酸消旋酶结构家庭的系统发育研究。
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汲沦谷H,回购,约翰逊女士,Salminen助教
氨基酸脱羧酶的功能分类丙氨酸消旋酶结构家庭的系统发育研究。
另一个星球杂志。2007年1月,24 (1):79 - 89。Epub 2006年9月22日。
- PubMed ID
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16997906 (在PubMed]
- 文摘
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精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)参与腐胺的生物合成,其他多胺的前体在动物、植物和细菌。这些pyridoxal-5 -phosphate-dependent脱羧酶属于丙氨酸消旋酶(AR)结构家庭一起diaminopimelate脱羧酶(DapDC),在细菌催化赖氨酸生物合成的最后一步。我们已经构建了一个多重序列比对脱羧酶的基于“增大化现实”技术的结构和家人,对齐的基础上,推断出系统发育树。种系发生树由3个不同的演化支由ADC, DapDC, ODC分化从一个祖先的脱羧酶。祖先脱羧酶可能是能够识别一些基质,在古菌和细菌,ODC可能保留绑定其他氨基酸的能力。以前,一个ODC paralogue提出了占ADC活动在哺乳动物细胞中发现。根据我们的结果,这似乎不太可能,强调需要更多的谨慎的功能分配使用序列数据和说明的持续价值澄清关系和假定的系统发育分析功能。